POLQ

POLQ
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4X0P, 4X0Q, 5AGA, 5A9J, 5A9F
Ідентифікатори
Символи	POLQ, POLH, PRO0327, polymerase (DNA) theta, DNA polymerase theta, DNA polymerase θ
Зовнішні ІД	OMIM: 604419 MGI: 2155399 HomoloGene: 32727 GeneCards: POLQ
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • DNA binding; • nucleotidyltransferase activity; • GO:0043142 single-stranded DNA helicase activity; • 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity; • chromatin binding; • damaged DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • DNA-directed DNA polymerase activity; • ATP binding; • 5'-3' exonuclease activity; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • хромосома; • клітинне ядро; • цитоплазма;
Біологічний процес	• somatic hypermutation of immunoglobulin genes; • negative regulation of double-strand break repair via homologous recombination; • double-strand break repair via alternative nonhomologous end joining; • cellular response to DNA damage stimulus; • реплікація ДНК; • double-strand break repair via homologous recombination; • protein homooligomerization; • GO:0100026 Репарація ДНК; • base-excision repair; • DNA biosynthetic process; • double-strand break repair; • DNA-dependent DNA replication; • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10721
	77782
	ENSG00000051341
	ENSMUSG00000034206
	O75417
	Q8CGS6
	NM_199420; NM_006596
	NM_001159369; NM_029977
	NP_955452
	NP_001152841; NP_084253
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

POLQ (англ. DNA polymerase theta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 590 амінокислот, а молекулярна маса — 289 619^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNLLRRSGKR	RRSESGSDSF	SGSGGDSSAS	PQFLSGSVLS	PPPGLGRCLK
AAAAGECKPT	VPDYERDKLL	LANWGLPKAV	LEKYHSFGVK	KMFEWQAECL
LLGQVLEGKN	LVYSAPTSAG	KTLVAELLIL	KRVLEMRKKA	LFILPFVSVA
KEKKYYLQSL	FQEVGIKVDG	YMGSTSPSRH	FSSLDIAVCT	IERANGLINR
LIEENKMDLL	GMVVVDELHM	LGDSHRGYLL	ELLLTKICYI	TRKSASCQAD
LASSLSNAVQ	IVGMSATLPN	LELVASWLNA	ELYHTDFRPV	PLLESVKVGN
SIYDSSMKLV	REFEPMLQVK	GDEDHVVSLC	YETICDNHSV	LLFCPSKKWC
EKLADIIARE	FYNLHHQAEG	LVKPSECPPV	ILEQKELLEV	MDQLRRLPSG
LDSVLQKTVP	WGVAFHHAGL	TFEERDIIEG	AFRQGLIRVL	AATSTLSSGV
NLPARRVIIR	TPIFGGRPLD	ILTYKQMVGR	AGRKGVDTVG	ESILICKNSE
KSKGIALLQG	SLKPVRSCLQ	RREGEEVTGS	MIRAILEIIV	GGVASTSQDM
HTYAACTFLA	ASMKEGKQGI	QRNQESVQLG	AIEACVMWLL	ENEFIQSTEA
SDGTEGKVYH	PTHLGSATLS	SSLSPADTLD	IFADLQRAMK	GFVLENDLHI
LYLVTPMFED	WTTIDWYRFF	CLWEKLPTSM	KRVAELVGVE	EGFLARCVKG
KVVARTERQH	RQMAIHKRFF	TSLVLLDLIS	EVPLREINQK	YGCNRGQIQS
LQQSAAVYAG	MITVFSNRLG	WHNMELLLSQ	FQKRLTFGIQ	RELCDLVRVS
LLNAQRARVL	YASGFHTVAD	LARANIVEVE	VILKNAVPFK	SARKAVDEEE
EAVEERRNMR	TIWVTGRKGL	TEREAAALIV	EEARMILQQD	LVEMGVQWNP
CALLHSSTCS	LTHSESEVKE	HTFISQTKSS	YKKLTSKNKS	NTIFSDSYIK
HSPNIVQDLN	KSREHTSSFN	CNFQNGNQEH	QTCSIFRARK	RASLDINKEK
PGASQNEGKT	SDKKVVQTFS	QKTKKAPLNF	NSEKMSRSFR	SWKRRKHLKR
SRDSSPLKDS	GACRIHLQGQ	TLSNPSLCED	PFTLDEKKTE	FRNSGPFAKN
VSLSGKEKDN	KTSFPLQIKQ	NCSWNITLTN	DNFVEHIVTG	SQSKNVTCQA
TSVVSEKGRG	VAVEAEKINE	VLIQNGSKNQ	NVYMKHHDIH	PINQYLRKQS
HEQTSTITKQ	KNIIERQMPC	EAVSSYINRD	SNVTINCERI	KLNTEENKPS
HFQALGDDIS	RTVIPSEVLP	SAGAFSKSEG	QHENFLNISR	LQEKTGTYTT
NKTKNNHVSD	LGLVLCDFED	SFYLDTQSEK	IIQQMATENA	KLGAKDTNLA
AGIMQKSLVQ	QNSMNSFQKE	CHIPFPAEQH	PLGATKIDHL	DLKTVGTMKQ
SSDSHGVDIL	TPESPIFHSP	ILLEENGLFL	KKNEVSVTDS	QLNSFLQGYQ
TQETVKPVIL	LIPQKRTPTG	VEGECLPVPE	TSLNMSDSLL	FDSFSDDYLV
KEQLPDMQMK	EPLPSEVTSN	HFSDSLCLQE	DLIKKSNVNE	NQDTHQQLTC
SNDESIIFSE	MDSVQMVEAL	DNVDIFPVQE	KNHTVVSPRA	LELSDPVLDE
HHQGDQDGGD	QDERAEKSKL	TGTRQNHSFI	WSGASFDLSP	GLQRILDKVS
SPLENEKLKS	MTINFSSLNR	KNTELNEEQE	VISNLETKQV	QGISFSSNNE
VKSKIEMLEN	NANHDETSSL	LPRKESNIVD	DNGLIPPTPI	PTSASKLTFP
GILETPVNPW	KTNNVLQPGE	SYLFGSPSDI	KNHDLSPGSR	NGFKDNSPIS
DTSFSLQLSQ	DGLQLTPASS	SSESLSIIDV	ASDQNLFQTF	IKEWRCKKRF
SISLACEKIR	SLTSSKTATI	GSRFKQASSP	QEIPIRDDGF	PIKGCDDTLV
VGLAVCWGGR	DAYYFSLQKE	QKHSEISASL	VPPSLDPSLT	LKDRMWYLQS
CLRKESDKEC	SVVIYDFIQS	YKILLLSCGI	SLEQSYEDPK	VACWLLDPDS
QEPTLHSIVT	SFLPHELPLL	EGMETSQGIQ	SLGLNAGSEH	SGRYRASVES
ILIFNSMNQL	NSLLQKENLQ	DVFRKVEMPS	QYCLALLELN	GIGFSTAECE
SQKHIMQAKL	DAIETQAYQL	AGHSFSFTSS	DDIAEVLFLE	LKLPPNREMK
NQGSKKTLGS	TRRGIDNGRK	LRLGRQFSTS	KDVLNKLKAL	HPLPGLILEW
RRITNAITKV	VFPLQREKCL	NPFLGMERIY	PVSQSHTATG	RITFTEPNIQ
NVPRDFEIKM	PTLVGESPPS	QAVGKGLLPM	GRGKYKKGFS	VNPRCQAQME
ERAADRGMPF	SISMRHAFVP	FPGGSILAAD	YSQLELRILA	HLSHDRRLIQ
VLNTGADVFR	SIAAEWKMIE	PESVGDDLRQ	QAKQICYGII	YGMGAKSLGE
QMGIKENDAA	CYIDSFKSRY	TGINQFMTET	VKNCKRDGFV	QTILGRRRYL
PGIKDNNPYR	KAHAERQAIN	TIVQGSAADI	VKIATVNIQK	QLETFHSTFK
SHGHREGMLQ	SDQTGLSRKR	KLQGMFCPIR	GGFFILQLHD	ELLYEVAEED
VVQVAQIVKN	EMESAVKLSV	KLKVKVKIGA	SWGELKDFDV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі, хромосомах.

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9186 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, O75417 (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9186 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O75417 (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]